全自動高通量植物3D成像系統——Greenhouse Scanalyzer Systems

植物表型和生理研究的強大助手

遺傳育種、突變株篩選、表型篩選的強大工具

小型版 只能自動傳送10盆植物，需手動更換花盆	大型定制版（溫室版） 可自動傳送1200盆植物的系統

        全自動高通量植物3D成像系統——Greenhouse Scanalyzer Systems是一套可以全自動、高通量對大量植株（從幼苗到成熟植株即可）進行成像的系統，可以選擇配置可見光（VIS）成像、近紅外（NIR）成像、紅外（IR）成像、PSII熒光成像、高光譜成像和根系近紅外成像中的一種或多種，每個成像模塊包括頂部和側面兩個攝像頭，結合樣品旋轉裝置，就可以對植株進行3D形態學分析。如果做小植株（15 cm以下），也可選配激光掃描3D成像。每一種成像模塊都有單獨的成像區域（“暗房”），依次進行成像分析。

主要功能

全自動、高通量對植物等小型樣品進行可見光成像、近紅外成像、根系近紅外成像、高光譜成像、紅外成像、熒光成像（包括整株GFP成像）和/或激光掃描3D成像（每套系統可選擇一種或多種）

通過可見光成像可以測量植物的結構、寬度、密度、對稱性、葉長、葉寬、葉面積、葉角度、葉顏色、葉病斑、種子顏色、種子顏色面積等等50多個參數

通過近紅外成像可以分析植物的水分分布狀態、水力學研究、脅迫生理學研究等

通過根系近紅外成像分析植物根系和土柱中的水分分布情況

通過紅外成像可以進行植物干旱脅迫研究、蒸騰研究等

通過熒光成像可以分析植物的生理狀態

通過高光譜成像可以測量一些特定的物質的量和歸化指數

應用領域

植物生理學、農業科學、植物病理學、遺傳育種、突變株篩選、植物形態建模、種子生理學、種子病理學、植物脅迫生理學、植物水力學等研究領域。

可以自動傳送10盆植物的小型系統	T-Junction分選
自動灌溉裝置	側面、側面旋轉90度和頂部成像

應用實例

植物顏色分類

        植物的顏色是反映植物健康狀態的關鍵指標之一，而人肉眼對顏色的敏感度較低，存在較大的視覺誤差。利用Scanalyzer系統可以在拍攝植物可見光照片的基礎上，通過軟件對獲得的顏色信息進行銳化處理，從而使原本肉眼不易區分的顏色差別，顯著的區分開來。

植物骨架/結構分析

        植物骨架和架構信息，是非常典型的植物表觀信息，是農業信息學的重要研究內容。對于雜交育種而言，Scanalyzer系統有助于快速進行表型篩選，也可用于了解整個生活史以及受到脅迫后的骨架/結構變化。

植物形態學分析

        成像后，通過LemnaTec公司專業的軟件工程師團隊開發的軟件，可以對植物進行詳細的三維形態學分析。對于所拍攝的每一張圖片，都可獲得多個形態學參數。

估算生物量

        通過頂部成像和多個側面成像，可以獲得植物X、Y、Z三個軸的信息，根據各個方向的葉面積、莖長、莖寬、葉長、顏色等來估算植物的生物量。實驗證明這種估算的生物量與實際生物量有非常好的線性關系。

利用近紅外（NIR）成像分析植株和土壤的水分利用情況

        近紅外成像可以直觀的反映植物不同部位的含水量，通過軟件處理加上代表不同含水量的顏色后，可以非常直觀的看出不同處理下植株不同部位的含水量變化。如果植物是生長在專用土柱中，還可以對植物根系和土壤的含水量變化進行定量分析。

注：LemnaTec公司設計的土柱筒，是透明聚丙烯塑料材質，內裝自然土壤，高50 cm，直徑5、8或10 cm，裝土1.5  3.0  5.0 kg，底部有排水孔。培養時土柱外部套上不透明PVC管遮蔭，放置苔蘚和土壤藻類滋生，測量時將遮光管取下即可。

利用近紅外（NIR）成像分析NIR成像分析小麥干燥過程中含水量的變化

        本例是小麥在高溫處理下，植株含水量的時間動力學變化可以通過NIR成像直觀的反映處來，并進行定量分析。

利用紅外（IR）成像檢測植物溫度差異

        紅外成像，也叫熱成像，用于檢測植株的溫度變化。由于植株溫度與植物的蒸騰作用和含水量密切相關，因此紅外成像常用于干旱脅迫研究、群體蒸騰等領域。

利用紅外成像反映小麥氣孔的關閉

        照光時氣孔開放，葉片進行蒸騰作用。關光4 min后就檢測到葉片溫度的顯著上升，說明氣孔開始關閉。Scanalyzer 3D系統可以非常靈敏的檢測氣孔狀態。

靜態根密度分析

        Scanalyzer 3D系統可以拍攝生長在土柱中的植物根系可見光照片，軟件自動分析土柱表層的根系。由于土柱的運輸車下自帶程序控制的旋轉臺，就可以通過軟件控制自動順序旋轉90度角來完成4個不同側面的成像，獲得更完善的根系信息。

根系動態生長分析

        Scanalyzer 3D系統可以全自動、高通量的拍攝植物根系照片，結合電子標簽，就可以對特定編號的植物根系數據進行時間動力學分析。從下圖中的結果可以看出，從第35-100天，根生長最快，從表層有大量的根往下生長，從第35-60天，澆水過量，導致底部很多根死亡。

鑒定非轉基因植物

        噴灑農藥后，沒有轉入抗農藥基因的植物，可以通過顏色鑒定出來。

植物個體和群體的形態學應用舉例

        Scanalyzer 3D成像系統可以獲得大量的形態學參數，并且針對不同的材料，可以獲得有針對性的參數。下面是幾個例子：

植物開花過程的動態監測

        由于絕大多數植物的花的顏色與莖葉不同，利用Scanalyzer 3D成像系統的高通量、全自動、帶電子標簽的特性，就可以自動監測植物是否開花、開花時間、花朵數目、花朵發育階段、花敗時間等信息。